Действие анимационного фильма происходит в эпоху Сэнгоку. Самурай Тоёхиса Симадзу был сильно ранен. Истекая кровью, он с трудом пытается покинуть поле боя, но неожиданно герой оказывается в длинном туннеле, в котором он находит множество дверей. Поджидавший самурая человек в очках помогает Тоёхисе найти для него нужную дверь. Когда герой приходит в сознание, он понимает, что очутился не на небесах, как он предполагал, а в параллельном мире.

17-летний Сосуке Сагара, который работает на военную организацию МИФРИЛ, поступает в школу, чтобы стать тайным телохранителем некой Канаме Тидори. На эту обычную, на первый взгляд, девушку охотятся террористы, убеждённые, что она обладает необычными и ценными сверхъестественными способностями.

Спустя 20 лет после аварии на атомной электростанции, превратившую половину Японии в безжизненную пустыню, сформировывается специальная команда, которая отправляется на поиски выживших.