Эдвард и Альфонс Элрики, владеющие искусством алхимии, пытались вернуть к жизни свою мать, которая скончалась от болезни. Но бросив такой дерзкий вызов судьбе, они забыли о главном Законе алхимии, который гласит: чтобы получить желаемое, ты должен отдать что-то равноценное этому. Их эксперимент закончился неудачей, вследствие чего Эдвард лишился руки и ноги, а младший брат и вовсе всего тела. Но Эдвард успевает запечатать душу брата в стальных доспехах. Повзрослев и набравшись опыта, братья отправляются на поиски философского камня, который позволяет обойти Закон, чтобы закончить начатое.

Анимационная история, созданная по мотивам японской манги про гениального хирурга по имени Блэк Джек, нелегально спасающего жизни людей, от которых отказалась официальная медицина. Бедных и обездоленных он лечит бесплатно. Богатые пациенты платят высокую цену и получают урок смирения.