После смерти своего мужа Кайли вместе с маленькой дочерью Джулией отправляется в Нью-Йорк на сверхсовременному «Боинге-747». Через некоторое время после взлёта Джулия пропадает, однако Кайли никто не верит. Ей твердят, что дочери с ней не было, более того она тоже умерла вместе с её мужем. Кайли твёрдо уверена, что её дочь жива и намерена найти её сама.
Агенту Джейсону Борну придётся вновь доказать, что он может всё: разобраться с заговором, выполнить задание государственного значения, спасти близких и себя.