Супермен вернулся на Землю, однако здесь всё изменилось. Люди привыкли жить без героя, а его любимая Доис Лэйн прекрасно устроила свою жизнь. И только вечный враг Лекс Лютор готов снова противостоять Супермену. Тем не менее герой готов встать на защиту Земли и её обитателей.

Шаткое положение мутантов в общества становится еще более отчаянным, когда неизвестный мутант пытается убить Президента США. Ответом на это покушение становится закон об обязательной регистрации мутантов. Автором этого закона становится бывший военный, который тайно проводил и проводит опыты над мутантами.