После смерти матери близнецы - брат и сестра - вместе с завещанием получают два письма. Одно - для их отца, которого они считали мёртвым, второе - для брата, о котором они никогда не слышали. Близнецы понимают, что они совершенно не знали своей матери, и отправляются на Ближний Восток, чтобы найти потерянных родственников и раскрыть тайну жизни женщины, которая их родила.

Спустя два года после битвы автоботов и десептиконов на Земле, Сэм закончил школу и собирается переехать в колледж. Он пытается вернуться к нормальному существованию и минимизировать инопланетное вторжение в свою жизнь, что весьма сложно сделать, если твой лучший друг - автобот Бамблби. Однако десептиконы не были окончательно повержены, и теперь их главная цель - месть.