После долгих лет в разлуке Сэм Флинн получил послание от своего пропавшего отца. Выясняя откуда оно могло прийти, Сэм неожиданно попадает в тот же виртуальный мир, где 20 лет томится его отец. Теперь ему необходимо выжить, чтобы найти выход в реальность.

Четыре американских солдата были посланы в Ирак, чтобы добыть печатные формы 100 долларовых купюр, используемые фальшивомонетчиками. Выполнив работу и вернувшись на базу, они узнают, что их командир убит взрывом, а формы украдены. Их же обвиняют во всём этом, и военный суд готов вынести приговор и разослать их по разным тюрьмам. Полгода спустя лидер квартета узнаёт кто украл формы и где его можно найти. Сбежав из тюрьмы, четвёрка отправляется на поиски настоящего преступника...

Когда-то великая цивилизация индейцев Майя создала календарь, согласно которому в 2012 Землю ждёт переход на другой уровень. Однако именно на 2012 году календарь обрывается. Что же ждёт нашу планету? Природа восстанет против человека: цунами, землетрясения и извержение вулканов готовы стереть города и целые страны с лица Земли. Тем временем люди стараются во чтобы то ни стало попасть на "ковчеги", специально построенные корабли, чтобы спасти человечество.

Людям Икс приходится бороться против своего же товарища. Джин Грей воскресла в образе Тёмного Феникса, чья сила превосходит силы любого мутанта в десятикратном размере. Она опасна для всех как для мутантов, так и для всего человечества. Однако в бой вступает другая сила - лекарство против мутации, способное сделать любого мутанта обычным человеком. Наступает время решающий битвы Людей Икс против людей Магнито.

Пятеро астронавта в далёком космосе попали под действие неизвестных лучей и приобрели каждый свою отдельную суперспособность. После возвращения на Землю четверым из них приходится использовать свои приобретённые способности для защиты людей от пятого - Доктора Виктора фон Дума.

Шаткое положение мутантов в общества становится еще более отчаянным, когда неизвестный мутант пытается убить Президента США. Ответом на это покушение становится закон об обязательной регистрации мутантов. Автором этого закона становится бывший военный, который тайно проводил и проводит опыты над мутантами.