Альтернативная реальность. Токио, 50-ые годы XX века. Город утопает в волнах насилия и жестокости. Подпольная организация «Секта», устраивает массовые беспорядки и терракты. Отвечая на вызов террористов, власти создают особое подразделение — «Волчий отряд», состоящий из специально подготовленных, закованных в броню, неуязвимых, безжалостных убийц.

2032-ой год. Техника достигает колоссально прогресса. Люди живут под одним небом вместе с киборгами и роботами. Бато — детектив из отдела полиции по борьбе с терроризмом. У него искусственное тело, а от человека остался только мозг и воспоминания о Мотоко Кусанаги.