После того, как Белка в погоне за орехом расколола Земной шар, континент начал делиться на материки. В результате этого катаклизма, друзья Мэнни, Диего и Сид отделяются от остального стада и своих друзей. Они отправляются в новое путешествие, где их ожидают экзотические морские существа, безжалостные пираты и новый неизведанные мир.