Гомункулус — существо искусственное. Выращенный в реторте знаменитым ученым профессором Гансеном и его ассистентом Родином, он превращается в человека редкостного интеллекта и несгибаемой воли. Однако, узнав тайну своего происхождения, он чувствует себя отщепенцем и тоскует по любви, чтобы избавиться от рокового одиночества. Неодолимое желание любви гонит его в далекие страны, где никто не знает тайну его рождения, но правда всплывает наружу, и сколько ни старается Гомункулус склонить к дружбе человеческие сердца, люди в ужасе отшатываются от него, крича: «Это Гомункулус, человек без души, прислужник дьявола, чудовище!» Когда они убивают его собаку, безутешный Гомункулус проникается таким презрением к человечеству, что даже единственный друг Родин не в состоянии его переубедить.

Аннушка — молодая еврейка, вынужденная уехать в Санкт-Петербург из-за клеветы. Федя — сын богатого купца Суховерского, бездельник и бедняк. Саша — увлечённый революционными идеями юноша, павший жертвой предательства двойного агента Рыловича. Яков Сегал — брат Аннушки, проклятый семьёй за то, что крестился в православие. Пути этих людей неожиданно пересекутся, когда Рылович по заданию главы тайной полиции отправится в провинцию в облике монаха подстрекать простой народ на еврейские погромы.

Анна — бывшая фрейлина, которую возжелал король Генрих VIII и для того чтобы добиться ее, вынужден был жениться на ней в 1533 году, после того как заставил представителей своей церкви развести его с первой женой Екатериной Арагонской, даже вопреки отказу Римского папы под угрозой отречения и проклятия…