Как выяснилось, Годзилла, убитый кислородом-разрушителем, был не единственным своем роде. Вскоре появляется еще один Годзилла, которого на этот раз называют Гигантисом. Гигантис появляется вместе с другим монстром — Ангирусом. Гигинатис и Ангирус появляются в Осаке, где начинают сражение. После долгой и упорной борьбы Гигантис убивает Ангируса и продолжает крушить город. Вскоре люди придумывают план, как избавиться от монстра…

В океане начинают пропадать японские корабли. От них остаются только оборванные радиограммы, сообщающие о столбах пламени, рвущихся из океана. Вскоре причина этих инцидентов всплывает наружу. Точнее, выходит на своих лапах. Это 50-метровый древний ящер, разбуженный испытаниями в океане американского ядерного оружия. Он начинает уничтожать все на своем пути и теперь опасность грозит не только Японии, но и всему миру…

Спасатели находят жертв недавнего кораблекрушения на острове Бейру, на котором ранее проводились испытания ядерного оружия. К их удивлению, у выживших не наблюдается никаких признаков воздействия радиации. В ходе исследования острова учёные встречают множество странных вещей, а также двух крошечных фей, которых лидер экспедиции решает похитить и забрать с острова. Но на его беду эта парочка имеет телепатическую связь с гигантским мотыльком по имени Мотра, который немедленно вылетает на выручку своим феям.

После того, как подозреваемый в торговле наркотиками исчезает с места происшествия, оставив после себя всю одежду, полиция допрашивает его девушку и отправляется в клуб, где она работает. Полицейские в тупике и никак не могут объяснить его исчезновения. Однако тут появляется учёный, утверждающий, что испытания водородной бомбы вызвали мутацию и спровоцировали появление новых существ — «водородных людей», которые поглощают всё, к чему прикасаются.

Фильм рассказывает историю Mизуно, библиотекаря из санатория, которому дали способность стать паром после того, как ученый провёл эксперимент на нем.

Когда в отдалённом регионе Японии находят редкий вид бабочки, туда отправляется пара энтомологов и пропадает без вести. Сестра одного из пропавших учёных в компании с коллегами отправляется вслед за братом. Добравшись до деревни, где первую парочку видели последний раз, путешественники узнают историю о живущем в здешней долине гигантском монстре.

В 4 веке н. э. Узо, сын императора Кейко должен был наследовать престол, но вассал императора Отомо поставил на сводного брата Узо. Он решил отправить Узо на неминуемую смерть. Но храбрый Узо победил врагов и вернулся на родину с честью и новым именем — Ямато Такеру. Отомо плетет новый заговор, но боги помогают герою во всех начинаниях.