Девочка Тихиро и её семья по пути к новому загородному дому попадают в дорожное происшествие. Выйдя из машины, они обнаруживают неподалёку ресторан с соблазнительными яствами, но подозрительно то, что в нём нет обслуживающего персонала. Все принимаются за трапезу, кроме девочки, которая чувствует опасность. Подозрения Тихиро оказываются правдой: её родители превращаются в свиней, и она узнаёт, что это место кишит призраками.

Маленькая любопытная рыбка Поньо — дочь колдуна и прекрасной морской богини уплывает из дома, чтобы понаблюдать за жизнью людей. Поньо застревает в банке и оказывается выброшенной на берег. Её подбирает пятилетний Сооскэ, и они привязываются друг к другу. Теперь у Поньо только одно желание — стать человеком!

Япония, 1924 год. Девочку, от которой отказалась её родная мать, берёт на воспитание станционный смотритель из живописной деревушки, где обитают комичные местные жители.